مدیر کل دفتر واردات گمرک ایران بخشنامه شماره 61401/31938/113/323/73/9 مورخ 1391.4.7 را به شرح زیر اعلام نموده است:
به پیوست تصویر مصوبه شماره 31639/ت 48003 ک مورخ 91.2.20 هیات وزیران در خصوص کالای تولید شده در مناطق آزاد تجاری- صنعتی و ویژه اقتصادی ارسال می گردد. با عنایت به مواد 15 و 16 قانون مناطق آزاد تجاری- صنعتی و ماده 11 قانون مناطق ویژه اقتصادی و نیز بند "ب" ماده 112 قانون برنامه پنجم، خواهشمند است دستور فرمایید با رعایت کلیه مقررات مربوطه و با مدنظر قرار داتن نکات ذیل اقدام لازم معمول دارند: 1- حقوق ورودی قطعات و مواد خارجی بکار رفته در کالاهای تولید یا پردازش شده در مناطق آزاد تجاری- صنعتی و ویژه اقتصادی هنگام ورود به سرزمین اصلی به میزان درصد ارزش افزوده (تعیین شده توسط کمیسیونه تعیین ارزش افزوده) کسر و مابقی اخذ خواهد گردید. 2- چنانچه مواد اولیه و قطعات خارجی بکار رفته در کالاهای تولید یا پردازش شده در مناطق پیش از انجام فرآیند تولید، ترخیص گردیده و مراتب در مجوز کمیسیون تعیین ارزش افزوده لحاظ گردیده باشدف با رعایت مهلت مقرر در ماده 135 قانون امور گمرکی (حداکثر ظرف مدت شش ماه از صدور سند ترخیص مواد اولیه) به هنگام ورود کالای تولید شده به سرزمین اصلی، مبلغی معادل درصد ارزش افزوده از حقوق ورودی پرداخت شده با رعایت مربوطه قابل استرداد خواهد بود. به عنوان مثال چنانچه حقوق ورودی مواد خارجی بکار رفته در تولید کالایی 40% و میزان ارزش افزوده دریافتی از کمیسیون تعیین ارش افزوده 35% بوده باشد آنگاه: 26%=(35%-1)×40 بدین ترتیب حقوق ورودی قابل اخذ از 40% به 26% کاهی می یابد. نام وارد کننده یا ظهار کنند قطعات و مواد اولیه خارجی می بایست همان شخص (حقیقی یا حقوقی) دارند معافیت ارزش افزوده باشد.
متن تصویب نامه شماره 31639/ت 48003 ک مورخ 1391.2.20 هیئت وزیران به شرح زیر است: وزیران عضو شورای هماهنگی مناطق آزاد تجاری- صنعتی و ویژه اقتصادی به استناد اصل یکصد و سی و هشتم قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران و با رعایت تصویب نامه شماره 159176/ت 43505 هـ مورخ 1388.8.10 تصویب نمودند: الف- متن ذیل جایگزین بند (1) تصویب نامه شماره 73577/ت 20628 هـ مورخ 1377.11.20 می شود. 1- واردات کالاهای تولید با پردازش شده در مناطق آزاد تجاری- صنعتی و ویژه اقتصادی به داخل کشور، معادل درصد مجاز قابل ورود کالا که توسط کمیسیون تعیین ارزش افزوده براساس مجموع ارزش افزوده و مواد و قطعات داخلی به کار رفته به قیمت کل کالای تولیدی تعیین می شود، بدون هر گونه محدودیتی مجاز است و علاوه بر عدم نیاز به ثبت سفارش و گشایش اعتبار، مشمول شرط غیرمجاز و مجزا مشروط نیز نمی باشد. ب- متن زیر به عنوان بند (4) به تصویب نامه یاد شده اضافه می شود: 4- حقوق ورودی قطعات و مواد خارجی (وارد شده از خارج کشور به منطقه) به کار رفته در کالاهای تولید یا پردازش شده در مناطق آزاد تجاری- صنعتی و ویژه اقتصادی هنگام ورود به سرزمین اصلی پس از کسر معافیت حاصل از ارزش افزوده (تعیین شده توسط کمیسیون تعیین ارزش افزوده) محاسبه و اعمال می گردد. این تصویب نامه در تاریخ 1391.2.18 به تأیید مقام محترم ریاست جمهوری رسیده است.